Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snw1Q9CSN1 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms