Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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