Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gm7815-201ENSMUST00000196104 832 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gm6859-201ENSMUST00000218614 989 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Olfr209-202ENSMUST00000208246 428 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Gm18124-201ENSMUST00000210695 706 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Gal-201ENSMUST00000025842 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms