Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms