Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms