Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms