Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms