Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms