Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Abcf3Q8K268 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Abcf3Q8K268 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Abcf3Q8K268 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Abcf3Q8K268 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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