Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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LgsnQ8CIX8 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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LgsnQ8CIX8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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LgsnQ8CIX8 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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LgsnQ8CIX8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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LgsnQ8CIX8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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LgsnQ8CIX8 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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LgsnQ8CIX8 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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LgsnQ8CIX8 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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LgsnQ8CIX8 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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LgsnQ8CIX8 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms