Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rdh13Q8CEE7 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.8 ms