Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ttc21aQ8C0S4 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ttc21aQ8C0S4 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ttc21aQ8C0S4 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ttc21aQ8C0S4 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ttc21aQ8C0S4 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ttc21aQ8C0S4 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ttc21aQ8C0S4 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ttc21aQ8C0S4 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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