Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccser1Q8C0C4 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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