Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx1bQ8BX32 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx1bQ8BX32 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx1bQ8BX32 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx1bQ8BX32 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx1bQ8BX32 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx1bQ8BX32 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx1bQ8BX32 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.4 ms