Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Ube3dQ8BX13 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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Ube3dQ8BX13 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Ube3dQ8BX13 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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