Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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