Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms