Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms