Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms