Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms