Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms