Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms