Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms