Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5460Q3UQ97 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5460Q3UQ97 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5460Q3UQ97 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5460Q3UQ97 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5460Q3UQ97 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5460Q3UQ97 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5460Q3UQ97 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5460Q3UQ97 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5460Q3UQ97 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5460Q3UQ97 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5460Q3UQ97 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5460Q3UQ97 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5460Q3UQ97 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5460Q3UQ97 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5460Q3UQ97 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5460Q3UQ97 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5460Q3UQ97 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5460Q3UQ97 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5460Q3UQ97 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5460Q3UQ97 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5460Q3UQ97 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5460Q3UQ97 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms