Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37214-201ENSMUST00000192860 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 1700014L14Rik-201ENSMUST00000211704 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43178-201ENSMUST00000197257 1386 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43556-201ENSMUST00000196186 681 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm31243-201ENSMUST00000197498 632 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r-ps146-201ENSMUST00000176131 525 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Scgb1b25-ps-201ENSMUST00000186419 415 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2707-201ENSMUST00000188979 714 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms