Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U6N9 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U6N9 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U6N9 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U6N9 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U6N9 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U6N9 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q3U6N9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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