Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Zfp825-202ENSMUST00000202645 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm14623-201ENSMUST00000121398 603 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm24211-201ENSMUST00000158264 107 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm17139-201ENSMUST00000163802 571 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Fam117bQ3U3E2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Fam117bQ3U3E2 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gimap4-204ENSMUST00000119575 900 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm12158-201ENSMUST00000130493 631 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms