Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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