Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms