Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms