Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
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