Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
AmbpQ07456 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
AmbpQ07456 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms