Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms