Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Sh3bp2Q06649 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Sh3bp2Q06649 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Sh3bp2Q06649 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Sh3bp2Q06649 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Sh3bp2Q06649 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Sh3bp2Q06649 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Sh3bp2Q06649 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Sh3bp2Q06649 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Sh3bp2Q06649 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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