Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Sec23aQ01405 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Sec23aQ01405 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Sec23aQ01405 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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