Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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