Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Acta2P62737 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms