Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P58686 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P58686 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P58686 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P58686 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P58686 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P58686 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P58686 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P58686 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P58686 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P58686 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P58686 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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P58686 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P58686 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P58686 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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