Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
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