Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Hoxc13P50207 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Hoxc13P50207 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Hoxc13P50207 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Hoxc13P50207 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Hoxc13P50207 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc13P50207 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Hoxc13P50207 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Hoxc13P50207 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Hoxc13P50207 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Hoxc13P50207 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Hoxc13P50207 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Hoxc13P50207 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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