Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Tnfsf9P41274 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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