Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprkP35822 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprkP35822 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms