Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112 ms