Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxc5P32043 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms