Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprmP28828 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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PtprmP28828 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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PtprmP28828 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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PtprmP28828 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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PtprmP28828 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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