Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fcer1aP20489 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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