Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Irf1P15314 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irf1P15314 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irf1P15314 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irf1P15314 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irf1P15314 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irf1P15314 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Irf1P15314 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irf1P15314 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Irf1P15314 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Irf1P15314 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irf1P15314 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irf1P15314 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
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Irf1P15314 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Irf1P15314 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Irf1P15314 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irf1P15314 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irf1P15314 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irf1P15314 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irf1P15314 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irf1P15314 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irf1P15314 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irf1P15314 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Irf1P15314 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Irf1P15314 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Irf1P15314 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Irf1P15314 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Irf1P15314 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Irf1P15314 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Irf1P15314 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Irf1P15314 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Irf1P15314 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irf1P15314 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irf1P15314 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Irf1P15314 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Irf1P15314 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irf1P15314 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Irf1P15314 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Irf1P15314 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Irf1P15314 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irf1P15314 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irf1P15314 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irf1P15314 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irf1P15314 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irf1P15314 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irf1P15314 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irf1P15314 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irf1P15314 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irf1P15314 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irf1P15314 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irf1P15314 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irf1P15314 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irf1P15314 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irf1P15314 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irf1P15314 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irf1P15314 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Irf1P15314 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irf1P15314 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irf1P15314 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irf1P15314 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irf1P15314 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Irf1P15314 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Irf1P15314 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Irf1P15314 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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