Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms