Protein–RNA interactions for Protein: P01680

Ig kappa chain V-IV region S107B, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01680 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01680 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01680 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01680 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01680 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01680 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
P01680 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01680 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01680 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01680 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01680 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01680 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01680 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01680 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01680 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01680 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01680 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01680 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01680 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01680 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01680 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01680 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01680 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01680 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01680 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01680 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01680 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01680 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01680 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01680 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01680 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01680 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01680 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01680 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01680 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01680 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01680 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01680 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms