Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops6O88545 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops6O88545 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops6O88545 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cops6O88545 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Cops6O88545 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Cops6O88545 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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